Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tube1Q9D6T1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms