Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttc9bQ9D6E4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ttc9bQ9D6E4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms