Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Q9D5Q8 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9D5Q8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9D5Q8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9D5Q8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9D5Q8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9D5Q8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9D5Q8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9D5Q8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9D5Q8 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9D5Q8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9D5Q8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9D5Q8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9D5Q8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Q9D5Q8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D5Q8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D5Q8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D5Q8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D5Q8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D5Q8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D5Q8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D5Q8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Q9D5Q8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms