Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Zcchc13Q9D548 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Zcchc13Q9D548 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Zcchc13Q9D548 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
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Zcchc13Q9D548 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Zcchc13Q9D548 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Zcchc13Q9D548 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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Zcchc13Q9D548 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
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Zcchc13Q9D548 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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Zcchc13Q9D548 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Zcchc13Q9D548 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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