Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C6

Lrp2bp, LRP2-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp2bpQ9D4C6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrp2bpQ9D4C6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrp2bpQ9D4C6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrp2bpQ9D4C6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrp2bpQ9D4C6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrp2bpQ9D4C6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrp2bpQ9D4C6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrp2bpQ9D4C6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrp2bpQ9D4C6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrp2bpQ9D4C6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrp2bpQ9D4C6 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrp2bpQ9D4C6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrp2bpQ9D4C6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrp2bpQ9D4C6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrp2bpQ9D4C6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrp2bpQ9D4C6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrp2bpQ9D4C6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrp2bpQ9D4C6 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrp2bpQ9D4C6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrp2bpQ9D4C6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrp2bpQ9D4C6 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrp2bpQ9D4C6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrp2bpQ9D4C6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrp2bpQ9D4C6 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrp2bpQ9D4C6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrp2bpQ9D4C6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrp2bpQ9D4C6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms