Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Syce1Q9D495 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms