Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sohlh2Q9D489 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sohlh2Q9D489 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sohlh2Q9D489 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sohlh2Q9D489 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sohlh2Q9D489 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sohlh2Q9D489 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sohlh2Q9D489 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sohlh2Q9D489 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sohlh2Q9D489 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sohlh2Q9D489 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sohlh2Q9D489 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh2Q9D489 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh2Q9D489 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh2Q9D489 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh2Q9D489 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh2Q9D489 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh2Q9D489 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh2Q9D489 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh2Q9D489 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh2Q9D489 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh2Q9D489 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh2Q9D489 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh2Q9D489 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh2Q9D489 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh2Q9D489 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh2Q9D489 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh2Q9D489 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh2Q9D489 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh2Q9D489 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh2Q9D489 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh2Q9D489 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh2Q9D489 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh2Q9D489 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh2Q9D489 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh2Q9D489 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh2Q9D489 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh2Q9D489 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh2Q9D489 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh2Q9D489 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh2Q9D489 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh2Q9D489 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh2Q9D489 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh2Q9D489 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh2Q9D489 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh2Q9D489 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh2Q9D489 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh2Q9D489 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh2Q9D489 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sohlh2Q9D489 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sohlh2Q9D489 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sohlh2Q9D489 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sohlh2Q9D489 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sohlh2Q9D489 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sohlh2Q9D489 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sohlh2Q9D489 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sohlh2Q9D489 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sohlh2Q9D489 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sohlh2Q9D489 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sohlh2Q9D489 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sohlh2Q9D489 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sohlh2Q9D489 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sohlh2Q9D489 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sohlh2Q9D489 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sohlh2Q9D489 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sohlh2Q9D489 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sohlh2Q9D489 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sohlh2Q9D489 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sohlh2Q9D489 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sohlh2Q9D489 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sohlh2Q9D489 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sohlh2Q9D489 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sohlh2Q9D489 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sohlh2Q9D489 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sohlh2Q9D489 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sohlh2Q9D489 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sohlh2Q9D489 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sohlh2Q9D489 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sohlh2Q9D489 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sohlh2Q9D489 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sohlh2Q9D489 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sohlh2Q9D489 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sohlh2Q9D489 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sohlh2Q9D489 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sohlh2Q9D489 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sohlh2Q9D489 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sohlh2Q9D489 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sohlh2Q9D489 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sohlh2Q9D489 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sohlh2Q9D489 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sohlh2Q9D489 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sohlh2Q9D489 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sohlh2Q9D489 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sohlh2Q9D489 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sohlh2Q9D489 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sohlh2Q9D489 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sohlh2Q9D489 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sohlh2Q9D489 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sohlh2Q9D489 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sohlh2Q9D489 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms