Protein–RNA interactions for Protein: Q9D300

Rasgef1c, Ras-GEF domain-containing family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1cQ9D300 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rasgef1cQ9D300 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rasgef1cQ9D300 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rasgef1cQ9D300 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rasgef1cQ9D300 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rasgef1cQ9D300 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rasgef1cQ9D300 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rasgef1cQ9D300 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rasgef1cQ9D300 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rasgef1cQ9D300 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rasgef1cQ9D300 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rasgef1cQ9D300 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rasgef1cQ9D300 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rasgef1cQ9D300 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rasgef1cQ9D300 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rasgef1cQ9D300 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rasgef1cQ9D300 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rasgef1cQ9D300 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rasgef1cQ9D300 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rasgef1cQ9D300 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rasgef1cQ9D300 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rasgef1cQ9D300 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rasgef1cQ9D300 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rasgef1cQ9D300 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rasgef1cQ9D300 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rasgef1cQ9D300 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms