Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trappc6bQ9D289 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trappc6bQ9D289 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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