Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Spns3Q9D232 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Spns3Q9D232 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms