Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1R9

Rpl34, 60S ribosomal protein L34, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl34Q9D1R9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl34Q9D1R9 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms