Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Susd3Q9D176 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms