Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hddc3Q9D114 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hddc3Q9D114 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms