Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F1

Ndc80, Kinetochore protein NDC80 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 642 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndc80Q9D0F1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Ndc80Q9D0F1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndc80Q9D0F1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndc80Q9D0F1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndc80Q9D0F1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndc80Q9D0F1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndc80Q9D0F1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndc80Q9D0F1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndc80Q9D0F1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndc80Q9D0F1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndc80Q9D0F1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndc80Q9D0F1 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndc80Q9D0F1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndc80Q9D0F1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndc80Q9D0F1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndc80Q9D0F1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ndc80Q9D0F1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ndc80Q9D0F1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ndc80Q9D0F1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndc80Q9D0F1 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndc80Q9D0F1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ndc80Q9D0F1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndc80Q9D0F1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ndc80Q9D0F1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ndc80Q9D0F1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndc80Q9D0F1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndc80Q9D0F1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ndc80Q9D0F1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ndc80Q9D0F1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ndc80Q9D0F1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ndc80Q9D0F1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ndc80Q9D0F1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndc80Q9D0F1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Ndc80Q9D0F1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndc80Q9D0F1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndc80Q9D0F1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndc80Q9D0F1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndc80Q9D0F1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndc80Q9D0F1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndc80Q9D0F1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndc80Q9D0F1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndc80Q9D0F1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndc80Q9D0F1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndc80Q9D0F1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndc80Q9D0F1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndc80Q9D0F1 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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