Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc47Q9D024 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc47Q9D024 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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