Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW6

Rnf146, E3 ubiquitin-protein ligase RNF146, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf146Q9CZW6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf146Q9CZW6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms