Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thumpd2Q9CZB3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thumpd2Q9CZB3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thumpd2Q9CZB3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thumpd2Q9CZB3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thumpd2Q9CZB3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thumpd2Q9CZB3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thumpd2Q9CZB3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thumpd2Q9CZB3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thumpd2Q9CZB3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Thumpd2Q9CZB3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thumpd2Q9CZB3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thumpd2Q9CZB3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thumpd2Q9CZB3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thumpd2Q9CZB3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thumpd2Q9CZB3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thumpd2Q9CZB3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thumpd2Q9CZB3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Thumpd2Q9CZB3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thumpd2Q9CZB3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thumpd2Q9CZB3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thumpd2Q9CZB3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thumpd2Q9CZB3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thumpd2Q9CZB3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thumpd2Q9CZB3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thumpd2Q9CZB3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thumpd2Q9CZB3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thumpd2Q9CZB3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thumpd2Q9CZB3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thumpd2Q9CZB3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thumpd2Q9CZB3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thumpd2Q9CZB3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thumpd2Q9CZB3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thumpd2Q9CZB3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thumpd2Q9CZB3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thumpd2Q9CZB3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thumpd2Q9CZB3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thumpd2Q9CZB3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thumpd2Q9CZB3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thumpd2Q9CZB3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thumpd2Q9CZB3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thumpd2Q9CZB3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thumpd2Q9CZB3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thumpd2Q9CZB3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thumpd2Q9CZB3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thumpd2Q9CZB3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thumpd2Q9CZB3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Thumpd2Q9CZB3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Thumpd2Q9CZB3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Thumpd2Q9CZB3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Thumpd2Q9CZB3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Thumpd2Q9CZB3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Thumpd2Q9CZB3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Thumpd2Q9CZB3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Thumpd2Q9CZB3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms