Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Snf8Q9CZ28 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snf8Q9CZ28 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms