Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ04

Cops7a, COP9 signalosome complex subunit 7a, mousemouse

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops7aQ9CZ04 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cops7aQ9CZ04 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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