Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mis12Q9CY25 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mis12Q9CY25 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mis12Q9CY25 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mis12Q9CY25 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mis12Q9CY25 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mis12Q9CY25 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mis12Q9CY25 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mis12Q9CY25 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mis12Q9CY25 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mis12Q9CY25 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mis12Q9CY25 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mis12Q9CY25 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mis12Q9CY25 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mis12Q9CY25 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mis12Q9CY25 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mis12Q9CY25 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mis12Q9CY25 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mis12Q9CY25 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mis12Q9CY25 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mis12Q9CY25 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms