Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Sgo1Q9CXH7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Sgo1Q9CXH7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Sgo1Q9CXH7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sgo1Q9CXH7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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