Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tdrd12Q9CWU0 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tdrd12Q9CWU0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms