Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

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Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Smurf1Q9CUN6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smurf1Q9CUN6 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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