Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rhobtb3Q9CTN4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhobtb3Q9CTN4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms