Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rprd1bQ9CSU0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rprd1bQ9CSU0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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