Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CRC3 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CRC3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CRC3 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CRC3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CRC3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Q9CRC3 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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