Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rdm1Q9CQK3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms