Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sar1bQ9CQC9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sar1bQ9CQC9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms