Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CQC3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CQC3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CQC3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CQC3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CQC3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CQC3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CQC3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CQC3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CQC3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CQC3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CQC3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CQC3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CQC3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CQC3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CQC3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CQC3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CQC3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CQC3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CQC3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CQC3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CQC3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CQC3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CQC3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Q9CQC3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CQC3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CQC3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CQC3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CQC3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CQC3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CQC3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CQC3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CQC3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CQC3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CQC3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CQC3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CQC3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CQC3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CQC3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CQC3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CQC3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CQC3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CQC3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CQC3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CQC3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CQC3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CQC3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Q9CQC3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQC3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQC3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Q9CQC3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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