Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA5

Med4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med4Q9CQA5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med4Q9CQA5 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms