Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Commd4Q9CQ02 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms