Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atg3Q9CPX6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atg3Q9CPX6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms