Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gtf2a1Q99PM3 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms