Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME3

Sncaip, Synphilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaipQ99ME3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SncaipQ99ME3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms