Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprtQ99M80 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprtQ99M80 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprtQ99M80 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprtQ99M80 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprtQ99M80 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprtQ99M80 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprtQ99M80 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprtQ99M80 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprtQ99M80 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprtQ99M80 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PtprtQ99M80 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprtQ99M80 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprtQ99M80 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprtQ99M80 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprtQ99M80 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprtQ99M80 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprtQ99M80 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprtQ99M80 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprtQ99M80 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprtQ99M80 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprtQ99M80 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprtQ99M80 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprtQ99M80 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprtQ99M80 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprtQ99M80 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprtQ99M80 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PtprtQ99M80 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PtprtQ99M80 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PtprtQ99M80 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PtprtQ99M80 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
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