Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cstf3Q99LI7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms