Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Usp16Q99LG0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Usp16Q99LG0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms