Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pagr1aQ99L02 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms