Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Vmp1Q99KU0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Vmp1Q99KU0 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Vmp1Q99KU0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Vmp1Q99KU0 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Vmp1Q99KU0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Vmp1Q99KU0 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmp1Q99KU0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Vmp1Q99KU0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmp1Q99KU0 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmp1Q99KU0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmp1Q99KU0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmp1Q99KU0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmp1Q99KU0 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmp1Q99KU0 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vmp1Q99KU0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Vmp1Q99KU0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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