Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PpifQ99KR7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
PpifQ99KR7 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms