Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Rab28Q99KL7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Rab28Q99KL7 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rab28Q99KL7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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