Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Dok4Q99KE3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Dok4Q99KE3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Dok4Q99KE3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Dok4Q99KE3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Dok4Q99KE3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Dok4Q99KE3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Dok4Q99KE3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dok4Q99KE3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms