Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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TrabdQ99JY4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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TrabdQ99JY4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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TrabdQ99JY4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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TrabdQ99JY4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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TrabdQ99JY4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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TrabdQ99JY4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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TrabdQ99JY4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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TrabdQ99JY4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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TrabdQ99JY4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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TrabdQ99JY4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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TrabdQ99JY4 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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TrabdQ99JY4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TrabdQ99JY4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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