Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR1

Sfxn1, Sideroflexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn1Q99JR1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfxn1Q99JR1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms