Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ophn1Q99J31 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ophn1Q99J31 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms