Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ctu1Q99J10 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ctu1Q99J10 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms