Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nrif1Q923B3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrif1Q923B3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nrif1Q923B3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrif1Q923B3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nrif1Q923B3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nrif1Q923B3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrif1Q923B3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrif1Q923B3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrif1Q923B3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrif1Q923B3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrif1Q923B3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nrif1Q923B3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrif1Q923B3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nrif1Q923B3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nrif1Q923B3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrif1Q923B3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrif1Q923B3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrif1Q923B3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrif1Q923B3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrif1Q923B3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nrif1Q923B3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nrif1Q923B3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nrif1Q923B3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nrif1Q923B3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nrif1Q923B3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nrif1Q923B3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nrif1Q923B3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nrif1Q923B3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nrif1Q923B3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nrif1Q923B3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nrif1Q923B3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nrif1Q923B3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nrif1Q923B3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nrif1Q923B3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nrif1Q923B3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nrif1Q923B3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Nrif1Q923B3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nrif1Q923B3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms