Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pde6cQ91ZQ1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pde6cQ91ZQ1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pde6cQ91ZQ1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pde6cQ91ZQ1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pde6cQ91ZQ1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pde6cQ91ZQ1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pde6cQ91ZQ1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pde6cQ91ZQ1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms