Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx15Q91WE1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms