Protein–RNA interactions for Protein: Q91W86

Vps11, Vacuolar protein sorting-associated protein 11 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps11Q91W86 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Vps11Q91W86 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vps11Q91W86 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms